研究人类基因组计划所从事4张图谱的常规策略

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首先,要不断地丰富EST数据库。dbEST是目前最大的一个公共功能性序列数据库,至1996年夏天,它已收集到40万种EST序列。其中大多数序列是在默尔克(Merck)公司资助下由华盛顿大学的序列测定项目提供的。这个数目并不代表人类基因组中可表达基因的数目(6000到l00000个基因克隆),因为一个全长的CDNA可能产生几个不重叠的EST片段。美国人类基因组科学公司据称已得到了超过850000个EST片段的库,与人类基因组的全部基因数已相差不多了。现在,国际数据库中所贮存的EST的数量正以每日1000多个的速度增加着。
下一步就是将EST片段在人的基因组中定位。即将这些EST片段与某些疾病的易感位点联系起来,许多国家正在寻求合作,通过对这些EST片段进行染色体定位,绘制一个真正的"转录图谱"。这样,一旦确定了与某个疾病有关联的位点,转录图就可以告诉你在这个区域有哪些基因。是否所有的基因都能以EST片段的形式在染色体上得以定位呢?不是的。我们前面就已经知道EST片段是由mRNA经过反转录而来,不包括RNA的结构基因。此外,由于某些低水平表达的基因在构建CDNA文库时可能不包括于其中,因而EST中也不能代表这些低水平表达的基因。这样,RNA的结构基因以及低水平表达的基因就不能以EST的方式被定位到转录图上。这个悬而未决的问题将随着整个基因组序列的完成而得以解决。
有了一张总的转录图,我们就可以了解某基因在不同的时间、不同组织的表达情况;可以了解不同组织中不同基因的表达;还可以了解正常条件下与异常状况下基因表达的差异。因为一个EST本身就是某一特定具编码功能的基因的部分序列,提供了克隆、分析功能基因的一个起点。它本身可作为基因诊断和基因克隆的一种工具,可用于发现一些新的细胞因子、新的受体和其他具有商业用途的蛋白质。关于EST的序列是否应公布于众,EST序列能否申请专利问题的争论也近乎白热化。但无论如何,转录图将同其他三张图一起成为奠定ZI世纪医学的基石,为破译"基因"这部天书,认识和了解生命的真谛带来一个质的飞跃。
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科技